La linea Marunouchi è la seconda linea costruita in città e la prima costruita dopo la seconda guerra mondiale. La linea Marunouchi è servita da materiale rotabile della serie 02 della metropolitana di Tokyo in treni a sei carrozze sulla linea principale e treni a tre carrozze sul ramo Hōnanchō. La linea principale è la più frequente linea della metropolitana di Tokyo, con treni che viaggiano ad intervalli di 1 minuto e 50 secondi durante le ore di punta, come indicato nella mappa della linea Marunouchi. Nonostante il servizio ad alta frequenza, secondo un'indagine del 2008 del Ministero del Territorio, delle Infrastrutture, dei Trasporti e del Turismo, la linea Marunouchi è una delle più affollate di Tokyo, con una capacità del 157% tra le stazioni di Shin-ōtsuka e Myōgadani.

 

Su mappe, diagrammi e cartelli segnaletici, la linea Marunouchi viene mostrata utilizzando il colore "rosso" (▉) come si può vedere nella mappa della linea Marunouchi. Le stazioni della linea Marunouchi sono numerate con la lettera M; le stazioni della linea diramazione Hōnanchō portano una m minuscola. Il percorso della linea Marunouchi è a forma di U, che va dalla stazione di Ogikubo nella parte occidentale della città attraverso il distretto commerciale e amministrativo di Shinjuku fino al centro commerciale Marunouchi intorno alla stazione di Tokyo, prima di tornare indietro e dirigersi verso Ikebukuro.